土壤专题图数据库包含基于1:100万数字化土壤图产生的不同比例尺专题图件.包括中国土壤发生分类土壤类型图(分省),中国土壤系统分类土壤类型图,中国土壤主要营养元素分布图.数据正在逐步发布之中.

中国土种数据库   土种是有若干土壤特征相类似的一组土壤个体组成的集合体，选出其中心概念十分清晰的土壤个体为代表，作为评比土壤性状差异与划分土种的根据。 依据南京土壤所土壤分类研究成果和全国土壤普查办公室主编的“中国土种志(农业出版社)"，参照USDA土壤数据库的经验，建立了具有空间分布关系和分类层次关系的中国土种数据库。

农田土壤养分现状数据库包含了2000-2006年以来中国主要农田生态系统土壤养分现状数据，数据覆盖我国东北黑土、棕壤、潮土、风沙土、褐土、水稻土、红壤、黄绵土、黑垆土、紫色土、灰漠土等主要土壤类型。

农田土壤环境现状数据库 包含了2005年中国主要农田生态系统土壤环境现状数据，数据覆盖我国东北黑土、棕壤、潮土、风沙土、褐土、水稻土、红壤、黄绵土、黑垆土、紫色土、灰漠土等主要土壤类型。

养分循环长期试验数据库： 中国科学院从90年代起，以中国生态系统研究网络农业台站为平台，进行农田生态系统养分循环长期试验的联网研究。本数据库收集了该研究的部分成果和数据。

第二次土壤普查农田肥力数据库 依据第二次土壤普查数据,以土种为单位,提取了地形地貌、土地利用、土壤主要性状、生产性能和障碍因子，以及耕层土壤养分数据。便于土壤质量评价或不同时段土壤肥力的对比。

第一次农业土壤普查土壤肥力 数据来源于农业部土壤普查办公室《中国农业土壤志》（内部资料）。自1958年开始，1964年结束。受到当时条件局限，土壤分类和命名主要依据易被农民群众了解的土壤名称，土壤性状多为文字描述，是了解农田土壤肥力演变过程的珍贵历史资料。

土壤分类数据库包括中国土壤系统分类和发生分类的土纲、亚纲、土类、亚类以及对应的典型剖面数据。

参比土壤剖面数据库 参照FAO土壤分类和美国土壤系统分类(ST)，选择我国典型土壤类型进行参比。本数据库描述了参比土壤剖面的主要生境、形态和理化性质，供与国际主流土壤分类系统参比使用。

土壤标本数据库： 本数据库收集了南京土壤所和CERN若干野外台站的整段标本、生境信息和理化分析数据，对CERN野外台站土壤进行了中国土壤系统分类（CST）分类的划分研究，促进土壤长期监测数据的共享与国际交流。

土壤样品数据库  长期保存的土壤样品是长期生态学研究的宝贵财富.这些样品可以在较长时间尺度记录环境变化信息。土壤样品数据库提供了中国生态系统研究网络相关台站长期采样地可提供共享的土壤样品信息.